為什麼做pcr和測序用的引物不一樣

2021-03-11 08:16:20 字數 785 閱讀 9864

1樓:謇有福及子

pcr引物和測序引物是可以通用的,最多是純化方式不一樣,測序的要求高一些。版

權最重要的是,pcr擴增是從引物開始的,而測序一般要從引物下游幾十個bp以後,訊號才逐漸穩定,能夠讀出來。所以拿pcr引物去測序,那只能測出引物下游幾十個bp以後的片段,這樣你pcr的片段就會測不全。故而需要重新設計測序引物,一般要在所測片段的上游一些。

2樓:賈遠稱婉

測序bai用引物要求非常嚴格,du不同於pcr用引物zhi。pcr用引物一般只要能和模板dao結合,3』端的幾個鹼專基能完

全配對屬,即使引物長達80~100多個鹼基,只要調整pcr反應條件,也能成功進行pcr反應。

而測序用引物便不一樣了,必須嚴格符合以下要求。

(1)長度在15~25個鹼基左右,一般選擇20個鹼基(根據gc含量作適當調整),

(2)3』端盡量選擇g或c鹼基(但不絕對),以增加與模板的結合能力。

(3)tm溫度應選擇50℃~70℃左右。

(4)gc含量應選擇在50%左右,盡量避開a、t、g、c的連續結構。

(5)避開引物自身形成髮夾結構或引物二聚體結構等複雜結構。

(6)保證引物和模板100%匹配,特別是3』端的幾個鹼基一定要100%匹配。同時必須嚴格保證引物和模板之間

只能有乙個結合位點。

3樓:呼新蘭騎丙

看產物濃度,一般迴圈28-35個週期的產物送去測序的時候給個10-15微公升就夠了。引物一般可以用通用引物就不用送,自己的引物需要送,一般也是10微公升足夠了。

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