做單轉殖測序是菌液好還是菌液pcr後測好

2021-03-04 06:25:28 字數 596 閱讀 8024

1樓:匿名使用者

菌液pcr有風險,因為pcr是有乙個級聯放大的效應在裡專面,只要在菌液屬中沾了一點轉化時用的核酸片段,就有可能會擴增出來。但是送去測序的時候,很可能是假陽性,沒有連入任何片段(以前我們就碰到過這種情況,而且還是通過藍白斑篩選的)。

如果實在沒有iptg和x-gal,也最好能先挑幾個單菌落去做菌落pcr,從中選取陽性的菌落去做液體搖菌,提質粒,找乙個目標判斷上有的酶做乙個單切,同時用自連的空載作為對照,看是否能夠切開。如果菌體轉殖切開了,空載切不開,才能說明找到了陽性轉殖。送去測序才比較可靠。

否則直接送去測序,很可能全是空載,白白耽誤時間。

為了節省時間,也可以先送去測序,等待測序的過程中,進行酶切驗證,對了更好,不對趕緊找其他的菌去送樣。

構建啟動子載體遇到了困難,總出現假陽性的轉殖,菌液pcr檢測不到目的片段卻可以檢測到gus片段

2樓:小學生

我想這是因為你的啟動子檢測載體設計的不合理造成的,你可以在啟動子前而加乙個轉錄終止子,以阻止這種假陽性訊號。

還有乙個原因是:如果是原核生物,啟動子本來就只有幾十甚至十幾個bp,pcr檢測不到很正常。

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