螢光定量PCR引物設計的問題

2021-03-04 04:41:01 字數 381 閱讀 2324

1樓:阿魯巴星人

ls說得很對

你可以手動改動幾個鹼基,降低引物裡面的dimer,主要是3'端沒有dimer就好。

錯配問題,可以用taqman探針來檢測,但是很貴,實在設計不出來再用。

可以多設計幾對,然後做個引物測試,挑選出幾對好的,再做qrt。

2樓:匿名使用者

你是直接用primer5設計的引物嗎?有時候時會遇到你說的問題,你可以在軟體設計出來的基礎上,手動的把你的引物移動幾個鹼基,可以減少一些二聚體或錯配,而且,軟體給出來的這些結果都只是計算值,你實際應用的時候,退火溫度都要五六十度了,即使有部分二聚體在這個溫度下也開啟了,如果害怕出問題,你可以針對同一轉錄組多設計幾對引物,然後選一組最好的用

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管家基因是用來定量的。用來計算相對表達量。管家基因在相同量樣品中的表達量我們認為是一致的。然後根據這個量來計算你的基因在不同樣品中的表達量。所以每乙個都需要單獨的樣品。基因組干擾需要你在提取rna以後用dnase處理樣品。如果不放心,可以拿處理過的rna做膜版,跑一次,如果有帶就是有汙染,如果沒有可...