普通RTPCR與實時螢光定量PCR的引物有什麼區別

2021-03-04 04:58:15 字數 2698 閱讀 8100

1樓:常映寒黃彥

區別

如果rt-pcr的擴增產物只有1,200bp,而且足夠保守可以定位螢光pcr的目的基因

那就可以通用

2樓:奉俏麗奈鯨

實時定量的引物設計要求比較高,可以按普通引物設計的方法來做,但是設計時要注意擴增的片段不能太大,最好在250bp-100bp之間.同時要保證這對引物有絕對的特異性,因為要是產生非特異性擴增的話,就不能準確的計量模板量了,這樣就失去了實時定量的意義了

3樓:僪文賦板惠

普通rt-pcr是半定量的。。即需要從條帶的亮度判斷量的相對多少。。

螢光定量pcr是定量的。。

因為兩者反應體系,要求有很大區別,引物通常不能通用。除了上面提到的螢光定量pcr產物要控制在60-200nt之間,退火溫度也比較高。。一般要達到60度

普通rt-pcr與實時螢光定量pcr的引物有什麼區別

4樓:匿名使用者

實時定量的引物設計要求比較高,可以按普通引物設計的方法來做,但是設計時要注意擴增的片段不能太大,最好在250bp-100bp之間.同時要保證這對引物有絕對的特異性,因為要是產生非特異性擴增的話,就不能準確的計量模板量了,這樣就失去了實時定量的意義了

rt-pcr與螢光定量 pcr有什麼區別

5樓:朵向日葵熊

實時螢光定量pcr技術,是指在pcr反應體系中加入螢光基團,利用螢光訊號積累實時監測整個pcr程序,最後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。

pcr(聚合酶鏈式反應)是利用dna在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,低溫(經常是60°c左右)時引物與單鏈按鹼基互補配對的原則結合,再調溫度至dna聚合酶最適反應溫度(72°c左右),dna聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補鏈。

恆溫pcr和實時螢光定量pcr的不同,是不同在實時螢光定量pcr的系統中加入了螢光染料(sybr green 或taqman 探針等等)。以sybr green為例,這種染料可以結合在雙鏈的dna上,當pcr不斷進行時,每一次退火生成的雙鏈dna也在增加,螢光染料結合也越多,螢光也越強。在機器中有乙個探測螢光的探頭,可以定量檢測螢光的強度,轉換成數值。

這樣就可以實時記錄反映體系中dna的反應情況。

螢光pcr更有優勢,因為螢光pcr靈敏度高於恆溫pcr,同樣**也高一些。

pcr,rt-pcr,實時螢光定量pcr的區別與聯絡

6樓:永恆的瞬間綻放

1、所說的pcr應該就是最常規的pcr,以dna為模板,通過上下游引物,實現dna的擴增。

2、rt-pcr一般情況下是指反轉錄pcr(reverse transcription),儘管有些資料上說實時螢光定量pcr也(realtime fluores-cence quantitative pcr)也簡稱rt-pcr,但是這是不對的,不推薦。

基本操作過程是將所提取的rna進行反轉錄,然後將所獲得的cdna作為模板,設計引物進行擴增,是一種檢測基因表達的常用方法。

3、實時螢光定量pcr也就是real-time pcr,其最大的作用是檢測樣品中的初始dna濃度。

至於三者的關係,rt-pcr和實時定量pcr應該都屬於pcr,在rna實驗中,這二者都會應用到。

例如你要比較2個組織中的某基因的表達差異,首先你要提取2個組織的總rna,然後通過rt-pcr檢測該基因是否在2個組織中有表達,然後通過實時定量pcr測定該基因在2個組織中的表達量是否具有顯著性差異。

擴充套件資料:

pcr原理

dna的半保留複製是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈dna在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈,在dna聚合酶的參與下,根據鹼基互補配對原則複製成同樣的兩分子拷貝。

在實驗中發現,dna在高溫時也可以發生變性解鏈,當溫度降低後又可以復性成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制dna的變性和復性,加入設計引物,dna聚合酶、dntp就可以完成特定基因的體外複製。

但是,dna聚合酶在高溫時會失活,因此,每次迴圈都得加入新的dna聚合酶,不僅操作煩瑣,而且**昂貴,制約了pcr技術的應用和發展。

耐熱dna聚合酶-taq酶的發現對於pcr的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個迴圈加酶,使pcr技術變得非常簡捷、同時也大大降低了成本,pcr技術得以大量應用,並逐步應用於臨床。

pcr技術的基本原理類似於dna的天然複製過程,其特異性依賴於與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。pcr由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構成:

①模板dna的變性:模板dna經加熱至93℃左右一定時間後,使模板dna雙鏈或經pcr擴增形成的雙鏈dna解離,使之成為單鏈,以便它與引物結合,為下輪反應作準備;

②模板dna與引物的退火(復性):模板dna經加熱變性成單鏈後,溫度降至55℃左右,引物與模板dna單鏈的互補序列配對結合;

③引物的延伸:dna模板-引物結合物在72℃、dna聚合酶(如taqdna聚合酶)的作用下,以dntp為反應原料,靶序列為模板,按鹼基互補配對與半保留複製原理,合成一條新的與模板dna鏈互補的半保留複製鏈,重複迴圈變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的「半保留複製鏈」,

而且這種新鏈又可成為下次迴圈的模板。每完成乙個迴圈需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。

螢光定量pcr和實時螢光定量pcr還有反轉錄pcr都是什麼呀?有什麼區別,分別是什麼作用啊?謝謝啊

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