轉錄組資料中rpkm代表什麼,轉錄組資料中RPKM代表什麼

2021-03-21 22:55:40 字數 1138 閱讀 1574

1樓:匿名使用者

轉錄組資料中,rpkm是reads per kilo bases per million reads的縮寫,代表每百萬reads中來自於某基因每千鹼基長度的reads數。

轉錄是遺傳資訊由dna轉換到rna的過程。作為蛋白質生物合成的第一步,轉錄是mrna以及非編碼rna(trna、rrna等)的合成步驟。是遺傳資訊從dna流向rna的過程。

即以雙鏈dna中的確定的一條鏈(模板鏈用於轉錄,編碼鏈不用於轉錄)為模板,以atp、ctp、gtp、utp四種核苷三磷酸為原料,在rna聚合酶催化下合成rna的過程。

轉錄組差異分析結果與fpkm值不符時怎麼辦

2樓:匿名使用者

什麼叫和fpkm不符合?是的edger做的差異表達嗎

在轉錄組測序分析中,對於沒有參考基因組資訊的序列怎樣進行註釋,差異分析 ???

3樓:土豆檸檬絲

轉錄本是來

乙個基因序列通過

源一種剪下後所得的能rna。以前說轉錄本都是說表達蛋白的。現在lncrna的研究多了,也說是乙個轉錄本了。

還有沒有參考基因組序列的,一般是不可能去go功能註釋的。因為去功能註釋的時候要有乙個背景。

4樓:得意兒的一撥一

沒有參考基因的話就拼接啊!組裝後得到unigene在nr,swissprot cog go kegg等庫註釋。差異基因分析參照rpkm

10g轉錄組 夠分析circrna嗎

5樓:匿名使用者

轉錄bai組資料中,rpkm是reads per kilo bases per million reads的縮寫,代表每百萬du

zhireads中來自於某基因每千鹼基長度的daoreads數。

轉錄是遺傳資訊

回由dna轉換到rna的過程。作答為蛋白質生物合成的第一步,轉錄是mrna以及非編碼rna(trna、rrna等)的合成步驟。是遺傳資訊從dna流向rna的過程。

即以雙鏈dna中的確定的一條鏈(模板鏈用於轉錄,編碼鏈不用於轉錄)為模板,以atp、ctp、gtp、utp四種核苷三磷酸為原料,在rna聚合酶催化下合成rna的過程。

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